Florian Fischer ist freischaffender Architekt in München. Er betreibt das Architekturbüro fischer-Z architekten zusammen mit seiner Partnerin Alexandra Zeilhofer seit 25 Jahren. Der Schwerpunkt ihrer Tätigkeit ist das öffentliche Bauen, insbesondere Kultur- und Bildungsbauten sowie der Wohnungsbau und das Bauen im Bestand. Mehrere Bauten sind durch renommierte nationale Institutionen mit Preisen ausgezeichnet und international veröffentlicht.
Das Studium führte Florian Fischer nach Braunschweig, Stuttgart (Diplom), die SCI-Arc , Southern California Institute of Architecture in Sta. Monica und die GSAPP der Columbia University in New York, wo er mit dem Master of Science sein Studium abschloss. Die amerikanischen Studienaufenthalte wurden durch Stipendien der Fulbright Kommission und des DAAD gefördert. Für beide Institutionen ist er noch heute beratend in Auswahlkommissionen tätig.
Prägend in der Studienzeit und unmittelbar danach waren Tätigkeiten bei Auer und Weber Architekten, München, Frank O. Gehry in Sta. Monica, UN-Studio (seinerzeit Van Berkel und Bos) in Amsterdam und dem Büro seines Vaters Erhard Fischer, München.
Florian Fischer ist Mitglied im Bund Deutscher Architekten BDA, dem Deutschen Werkbund und dem MAIV; Münchner Architekten und Ingenieurverein. 2001–2003 war Florian Fischer Vorsitzender des BDA-Kreisverbandes München-Oberbayern. Er ist Preisrichter in zahlreichen städtebaulichen und hochbaulichen Wettbewerbsjurys und Gutachterverfahren sowie Mitglied der Gestaltungsbeiräte in Würzburg (stellvertretend), Geretsried, München und aktuell in dieser Funktion in Kempten/Allgäu.

2009 erfolgte der Ruf an die Fachhochschule Nürnberg für das Lehrgebiet Entwerfen in Theorie und Praxis. Schwerpunkte in der Lehre sind die Vermittlung von Entwurfstechniken und deren theoretischer Grundlagen von der Bauhausepoche bis heute. Theorie in diesem Zusammenhang umfasst neben der »reinen« Entwurfs- und Architekturtheorie auch gesellschafts- und sozialtheoretische Texte und Debatten, die die fortschreitende Entwicklung der Architektur begleiten. Als praktizierender Architekt ist ihm in der Lehre der durchgängige Entwurf von der Skizze zum, für das Entwurfskonzept referentiellen und zugleich ausführungsreifen, Detail von besonderer Bedeutung. Ein weiterer Schwerpunkt seiner Lehre in der Disziplin Gebäudekunde ist die Auseinandersetzung mit maßgeblichen zeitgenöss-ischen und Bauten des 20. Jahrhunderts hinsichtlich des Zusammenhanges von Ort, Funktion, Struktur und Atmosphäre.
Florian Fischer ist im Sachverständigenausschuss für Internationale Beziehungen der Hochschule tätig.
Er ist glücklicher Vater von vier Kindern.